حالت‌های عملیاتی (Operation modes):

--help

نمایش این راهنما و خروج

--version

نمایش شماره نسخه و خروج

-v, --verbose

فهرست کردن پرجزئیات فایل‌های پردازش‌شده

--no-force

تنها به‌روزرسانی آن دسته از پرونده‌های Makefile.in که قدیمی هستند

-W, --warnings=CATEGORY

گزارش هشدارهای مربوط به دسته‌بندی CATEGORY

ردگیری وابستگی‌ها (Dependency tracking):

-i, --ignore-deps

غیرفعال کردن کد ردگیری وابستگی‌ها

--include-deps

فعال کردن کد ردگیری وابستگی‌ها

طعم‌ها (Flavors):

--foreign

تنظیم میزان سخت‌گیری روی حالت خارجی (foreign)

--gnits

تنظیم میزان سخت‌گیری روی حالت gnits

--gnu

تنظیم میزان سخت‌گیری روی حالت gnu

فایل‌های کتابخانه (Library files):

-a, --add-missing

افزودن فایل‌های استاندارد ناموجود به بسته

--libdir=DIR

تنظیم پوشه نگه‌دارنده فایل‌های کتابخانه

--print-libdir

چاپ نام پوشه نگه‌دارنده فایل‌های کتابخانه

-c, --copy

همراه با -a، کپی کردن فایل‌های ناموجود (پیش‌فرض پیوند نمادین است)

-f, --force-missing

اجبار به به‌روزرسانی فایل‌های استاندارد

دسته‌بندی‌های هشدار عبارت‌اند از:

cross

مشکلات مربوط به کامپایل متقاطع (cross compilation)

gnu

استانداردهای کدنویسی گنو (پیش‌فرض در حالت‌های gnu و gnits)

obsolete

قابلیت‌ها یا ساختارهای منسوخ‌شده (پیش‌فرض)

override

بازتعریف قوانین یا متغیرهای Automake توسط کاربر

portability

مشکلات مربوط به سازگاری و چندسکویی (پیش‌فرض در حالت‌های gnu و gnits)

portability-recursive

متغیرهای تودرتوی Make (پیش‌فرض همراه با -Wportability)

extra-portability

مشکلات تکمیلی سازگاری مربوط به ابزارهای نامتعارف

syntax

ساختارهای نحوی مشکوک (پیش‌فرض)

unsupported

قابلیت‌های پشتیبانی‌نشده یا ناقص (پیش‌فرض)

گزینه -W همچنین مقادیر زیر را می‌پذیرد:

all

فعال‌سازی همه هشدارها

none

غیرفعال‌سازی همه هشدارها

no-CATEGORY

غیرفعال‌سازی هشدارها در دسته‌بندی CATEGORY

error

در نظر گرفتن تمام هشدارهای فعال به‌عنوان خطا

فایل‌هایی که در صورت یافت شدن به طور خودکار توزیع می‌شوند (همیشه):

ABOUT-GNU

TODO install-sh mdate-sh

ABOUT-NLS

ar-lib libversion.in missing

BACKLOG

compile ltcf-c.sh mkinstalldirs

COPYING

config.guess ltcf-cxx.sh py-compile

COPYING.DOC

config.rpath ltcf-gcj.sh texinfo.tex

COPYING.LESSER

config.sub ltconfig ylwrap

COPYING.LIB

depcomp ltmain.sh

فایل‌هایی که در صورت یافت شدن به طور خودکار توزیع می‌شوند (در صورت نیاز با پسوند .md):

AUTHORS[.md]

INSTALL[.md] README[.md] THANKS[.md]

ChangeLog[.md]

NEWS[.md]

فایل‌هایی که در صورت یافت شدن به طور خودکار توزیع می‌شوند (تحت شرایط خاص):

README-alpha[.md]

config.h.bot configure configure.in

acconfig.h

config.h.top configure.ac stamp-vti

aclocal.m4